Asosiasi Program Pascasarjana Perguruan Tinggi Muhammadiyah ‘Aisyiyah (APPPTMA) diprakarsai oleh sejumlah pengelola program pascasarjana perguruan tinggi lingkup persyarikatan Muhammadiyah dan Aisyiah. Visi utama APPPTMA adalah memberdayakan dan meningkatkan kualitas dan daya saing pascasarjana Perguruan Tinggi Muhammadiyah ‘Aisyiyah baik dari aspek Sumber Daya Manusia (SDM) maupun institusi.
Kemudian pada tahun 2010 diadakan pertemuan bersama di Universitas Muhammadiyah Surakarta (UMS) eksistensi APPPTMA semakin progres, sejak saat itu telah dirumuskan sejumlah misi dan kebijakan sekaligus menegaskan bahwa APPPTMA sesungguhnya fokus pada persoalan-persoalan akademik, jauh dari politik kampus, terlebih politik kenegaraan. Sehingga program senangtiasa berorientasi pada peningkatan dan pengembangan visitasi akreditasi sebagai wujud peberdayaan institusi, meningkatkan kualitas penelitian, artikel, jurnal baik dalam bentuk kerjasama antara mahasiswa dengan para dosen Pasasrajana maupun kerjsama penelitian antara APPPTMA dengan PTMA lainnya sebagai wujud pemberdayaan dan peningkatan SDM.
Implemntasi program secara rutin dilakukan oleh pengurus dan anggota, pada Tahun 2011 APPPTMA menyelenggarakan Seminar dan Lokakarya di Universitas Muhammadiyah Yogyakarta (UMY), 2013 di Universitas Muhammadiyah Sumatera Utara (UMSU), 2014 di Universitas Muhammadiyah Makassar yang sekaligus menyepakati perubahan nama kegiatan yang sebelumnya seminar dan lokakarya menjadi Seminar dan Konferensi Nasional.
Sejak saat ini (2019) tercatat bahwa APPPTMA telah melakukan 8 kali Seminar dan Konferensi Nasional.
| No | Konferensi | Tempat | Waktu |
| 1 | Konferensi 1 | UM Yogyakarta | 12-13 Desember 2014 |
| 2 | Konferensi 2 | UM Palu, Sul-Sel | 8-10 Mei 2015 |
| 3 | Konferensi 3 | UM Perwoerto, Jawa Tengah | 12-13 Desember 2015 |
| 4 | Konferensi 4 | UM Palembang, Sum-Sel | 27-29 Mei 2016 |
| 5 | Konferensi 5 | UM Siduarjo, Jawa Timur | 24-26 Februari 2017 |
| 6 | Konferensi 6 | UM Pare-Pare dan STISIP Sidarap, Sul-Sel | 8-11 September 2017 |
| 7 | Konferensi 7 | UM Jakarta | 23-25 Maret 2018 |
| 8 | Konferensi 8 | UM Sumatera Utara | 30 November 2018 |
Keanggotaan
Ada dua jenis keanggotaan APPPTMA , yakni keanggotaan lembaga dan individual. Keanggotaan lembaga adalah semua perguruan tinggi muhammadiyah dan ‘Aisyiyah yang telah memiliki program pascasarjana. Kemudian Keanggotaan individual adalah Dosen-Donen tetap Yayasan Muhammadiyah yang mengajar di Pascasarjana dengan syarat telah bergelar Doktor (Dr/ Ph.D) dan memiliki Nomor Baku Muhammdiyah (NBM) dengan mengisi formulir kesediaan untuk menjadi anggota APPPTMA dan kepadanya diberi Kartu Tanda Anggota (KTA). Saat ini APPPTMA telah mengakomodasi 28 Pascasarjana dan 114 Program Studi (S2-S3).